إحدى الفروق الرئيسية بين عسل المانوكا الأسترالي و النيوزيلندي هي الموقع الجغرافي حيث يتم إنتاج العسل. يتم إنتاج عسل المانوكا النيوزيلندي في جزيرة الشمال و أعلى جزيرة الجنوب في نيوزيلندا، بينما يتم إنتاج عسل المانوكا الأسترالي في الولايات الشرقية لأستراليا، بما في ذلك كوينزلاند ونيو ساوث ويلز وفيكتوريا. كل منطقة لها مناخها و تربتها و نباتاتها المميزة، و التي قد تؤثر على خصائص و طعم عسل المانوكا الذي يتم إنتاجه فيها.

من المهم أن نلاحظ أن كل من عسل المانوكا الأسترالي و النيوزيلندي ذو جودة عالية ولديهما خصائصهما المميزة. يمكن أن يختلف مستوى (ميثيل جليوكسال), وهو مركب يوجد في عسل المانوكا ويُعتقد أنه يسهم في خصائصه المضادة للبكتيريا، بين النوعين من العسل. يمكن أن تتراوح مستويات الميثيل جليوكسال في عسل المانوكا من 0 إلى أكثر من 1000 ملجم/كغ. 

بينما يميل عسل المانوكا النيوزيلندي إلى أن يكون لديه مستويات أعلى من الميثيل جليوكسال مقارنة بعسل المانوكا الأسترالي، إلا أن هذا لا يعني بالضرورة أن يكون الأمر دائما كذلك.

في الحقيقة، تبين أن كل من أنواع عسل المانوكا لديها خصائص طبية و يمكن استخدامها لمجموعة واسعة من التطبيقات الصحية.

بإيجاز، يتم إنتاج عسل المانوكا الأسترالي و النيوزيلندي من نفس النبات و يعتبران من الجودة العالية. لديهما خصائص خاصة بهما، و لكن قد تظهر بعض الفروق الطفيفة في كمية الميثيل جليوكسال و أنواع التصنيفات والمزج المتاحة، ولكن كلاهما يعتبران خيارات رائعة.